国管公积金和市管公积金两者的区别如下：
1、缴纳人群不同
国管公积金是中央国家机关、在京单位等国管单位在职员工缴纳的公积金，市管公积金是地方省市单位、城镇企业、事业单位在职员工缴纳的公积金。
2、贷款时间不同
国管公积金贷款办理时间为45-60天，市管公积金贷款办理时间为30-45天。
3、还款方式不同
国管公积金贷款只可以选择等额本息和等额本息，市管公积金贷款可以自由选择还款方式。
4、使用范围不同
国管公积金可以跨地区使用，市管公积金只可以在缴纳地区使用。
5、信用制度不同
国管公积金没有信用评级，市管公积金有信用评级，信用评级越高贷款额度也就越高。