花呗修改还款金额后，修改后的金额大于等于最低还款金额，则不会对用户产生任何影响，因为只要还清了最低还款额，花呗就会视为用户已经按时还款。而修改后的还款金额小于最低还款金额，到了还款日当天系统发起自动扣款失败，之后宽限期内自动扣款仍然失败，用户后续也没有继续还款，那么还款金额小于最低还款，就会造成用户的花呗逾期。
花呗逾期后会有逾期记录上传到征信与芝麻信用中，这样用户的个人征信、芝麻信用都会受到负面影响。在逾期后尽快还清逾期的欠款，可以降低逾期记录的负面影响。而逾期记录存在的时间越久，产生的负面影响就会越大。花呗逾期后，部分功能会受到限制，同时借呗、备用金也会无法使用。
用户在给花呗还款时，还款金额至少要等于最低还款金额，这样才不会导致花呗逾期。至于后续仍然有还款能力，可以继续归还花呗，花呗支持用户进行多次还款。