花呗不会自动从客户绑定在支付宝上的信用卡里进行扣款。因为花呗虽然默认开通有自动还款功能，但一般只会从支付宝账户余额、绑定的借记卡，还有余额宝里进行扣款，信用卡是被排除在外的。毕竟信用卡也属于信贷产品，若扣款，扣的就是银行提供的授信额度，并非客户自己的资金。
大家需要注意，若是按默认顺序进行扣款，那就是先从支付宝账户余额里扣，然后是借记卡快捷/卡通（含网上银行，最多可轮询3张），之后再是余额宝（前提是开通了余额宝代扣功能，而钱转入余额宝除了保证还款以外，还可以获取一定收益）。
当然，客户也可以自行设置扣款顺序，比如可以将绑定的借记卡排在最前面，而银行卡最多可以轮询18张（若绑的卡低于18张，则按实际绑定卡数为准）。而扣款时若所有单个渠道额度不足，则会进行组合渠道扣款。