个人住房公积金贷款的利率的确要比商业性个人住房贷款的利率低。因为公积金贷款执行的是央行贷款基准利率，而在央行贷款基准利率当中，公积金贷款五年以上的年利率只有3.25%。二套房公积金贷款利率则为基准利率的1.1倍，也就是3.575%。
商业性住房贷款利率则是以相应期限的LPR为定价基准加点形成的（加点可为负值），且央行还规定了，首套商业性个人住房贷款利率不能低于相应期限LPR，二套商业性个人住房贷款利率不能低于相应期限LPR加60基点。
而在2020年10月20日，LPR报价是：1年期为3.85%，5年期以上为4.65%。所以首套商贷利率不低于4.65%，二套商贷不低于5.25%，可见要比公积金贷款利率高。
而只有未来5年期以上的LPR下行到低于3.25%了，那可能商贷利率才会比公积金贷款利率低，不过此种可能性并不大。